La storia del Domaine François Cotat è intimamente legata a quella della famiglia Cotat, che coltiva la vigna a Chavignol dalla fine della Seconda Guerra Mondiale. Già negli anni '40, i fratelli Francis e Paul Cotat gettano le fondamenta del Domaine. François eredita il Domaine nel 1998 e decide di proseguire nel solco dei metodi tradizionali. Suo cugino Pascal Cotat dirige a sua volta un Domaine distinto con sede a Sancerre, perpetuando così l'eredità familiare sotto due insegne separate.