Pour les amateurs souhaitant sélectionner les meilleures bouteilles du domaine Jacques-Frédéric Mugnier, certains millésimes se distinguent nettement. Parmi les années les plus remarquables pour les vins rouges figurent 1999, 2002, 2005, 2009, 2010, 2015, 2019 et 2020. Le Musigny 2015 a notamment reçu des notes maximales de la part des plus grands critiques internationaux, illustrant le niveau d'excellence que peut atteindre ce domaine dans les grands millésimes.